Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.466e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PDIA6-204ENST00000404824 2236 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.466e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 LINC00662-204ENST00000588027 562 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.486e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 VPS72-206ENST00000496809 913 ntTSL 512.04□□□□□ -0.483e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PCID2-206ENST00000375479 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PCID2-204ENST00000375459 1668 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 LCAT-202ENST00000570369 348 ntTSL 211.94□□□□□ -0.56e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.56e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 AVL9-202ENST00000409301 4336 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.56e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PDIA6-208ENST00000617249 2344 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.516e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ARMC9-204ENST00000436339 626 ntTSL 311.77□□□□□ -0.533e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZNF627-201ENST00000361113 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ARMC9-214ENST00000611582 5759 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.563e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 SZT2-209ENST00000562955 13968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.573e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZNF627-204ENST00000588174 2755 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PIK3CD-207ENST00000543390 3503 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.573e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 AACS-205ENST00000441247 2536 ntTSL 511.44□□□□□ -0.583e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 NR4A1-206ENST00000545748 3511 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.599e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 MYO18A-219ENST00000585573 319 ntTSL 311.29□□□□□ -0.66e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PIK3CD-201ENST00000361110 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.613e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 AACS-210ENST00000539251 555 ntTSL 411.24□□□□□ -0.613e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 TBCD-210ENST00000572953 702 ntTSL 511.22□□□□□ -0.613e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 TBCD-213ENST00000574422 879 ntTSL 211.16□□□□□ -0.623e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 OXA1L-206ENST00000473744 824 ntTSL 311.08□□□□□ -0.643e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 VPS72-205ENST00000491094 4267 ntTSL 511.05□□□□□ -0.643e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 MALRD1-202ENST00000377266 4461 ntTSL 510.95□□□□□ -0.666e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 DNMT3A-203ENST00000380746 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.676e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 TOP3A-216ENST00000583804 1465 ntTSL 510.86□□□□□ -0.676e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PCID2-216ENST00000622406 1937 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PCID2-201ENST00000246505 1786 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZC3H6-201ENST00000343936 11539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.766e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 TBCD-217ENST00000574975 867 ntTSL 510.28□□□□□ -0.763e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 AACS-202ENST00000316543 3115 ntTSL 210.27□□□□□ -0.763e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PDIA6-202ENST00000381611 2534 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.86e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 AKAP9-211ENST00000487258 3983 ntTSL 210.07□□□□□ -0.83e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 SEC24D-201ENST00000280551 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.813e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 EHBP1-201ENST00000263991 5165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PPARG-214ENST00000497594 1600 ntTSL 1 (best)9.92□□□□□ -0.826e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PDIA6-203ENST00000404371 2682 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.836e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 DYNLT1-203ENST00000367089 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.846e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZNF627-206ENST00000593279 588 ntTSL 49.72□□□□□ -0.856e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ARHGAP5-204ENST00000432921 5003 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.866e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.93e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PAPD7-203ENST00000511764 741 ntTSL 29.4□□□□□ -0.99e-15■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 SZT2-205ENST00000470139 4098 ntTSL 29.33□□□□□ -0.923e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PCSK6-202ENST00000398185 3723 ntTSL 1 (best)9.2□□□□□ -0.943e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.947e-24■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 NR4A1-211ENST00000548977 548 ntTSL 29.15□□□□□ -0.949e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PPARG-207ENST00000397015 1722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.966e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZFAND2A-204ENST00000471448 542 ntTSL 29.01□□□□□ -0.976e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.972e-8■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.977e-24■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 FREM1-203ENST00000380894 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.986e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 FREM1-205ENST00000427623 1421 ntTSL 58.89□□□□□ -0.996e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 CHD8-210ENST00000555962 1232 ntTSL 58.81□□□□□ -17e-24■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 NR4A1-208ENST00000547206 570 ntTSL 48.78□□□□□ -19e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PPARG-209ENST00000397026 2029 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.026e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 KDM4B-207ENST00000588961 560 ntTSL 48.61□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 OXA1L-207ENST00000481218 1596 ntTSL 58.56□□□□□ -1.043e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 UBE2W-204ENST00000519255 575 ntTSL 48.55□□□□□ -1.043e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZNF627-202ENST00000585493 541 ntTSL 48.37□□□□□ -1.076e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-218ENST00000587547 889 ntTSL 1 (best)8.33□□□□□ -1.086e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 OXA1L-213ENST00000612549 2971 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.083e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 LINC00662-207ENST00000590677 883 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.16e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 FAM204A-206ENST00000469758 1170 ntTSL 57.97□□□□□ -1.136e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 DISC1-208ENST00000427560 545 ntTSL 37.66□□□□□ -1.183e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.223e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 FNDC3B-211ENST00000490832 772 ntTSL 47.23□□□□□ -1.259e-15■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 NAA25-207ENST00000551858 2815 ntTSL 1 (best)6.88□□□□□ -1.316e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.323e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZFAND2A-207ENST00000574135 433 ntTSL 36.79□□□□□ -1.326e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 EFCAB11-203ENST00000550103 647 ntTSL 36.71□□□□□ -1.341e-6■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.356e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.367e-24■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 FAM204A-207ENST00000470476 1000 ntTSL 56.46□□□□□ -1.386e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 LINC00662-205ENST00000588150 493 ntTSL 36.37□□□□□ -1.396e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 SBF2-202ENST00000420722 1188 ntTSL 56.26□□□□□ -1.413e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 SORBS1-218ENST00000492542 720 ntTSL 36.2□□□□□ -1.426e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.446e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 EGLN1-202ENST00000476717 829 ntTSL 1 (best)6□□□□□ -1.453e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.56e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 NAA25-205ENST00000549711 2933 ntTSL 1 (best)5.64□□□□□ -1.516e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 AKAP9-204ENST00000394534 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.38□□□□□ -1.553e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.556e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.553e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.573e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.596e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 SEC24D-212ENST00000511715 2969 ntTSL 25.07□□□□□ -1.63e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PAXBP1-209ENST00000497873 2277 ntTSL 25.05□□□□□ -1.63e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.616e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.636e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 SEC24D-206ENST00000505134 3915 ntTSL 24.88□□□□□ -1.633e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.642e-6■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.656e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 NAA25-208ENST00000552527 5815 ntTSL 24.73□□□□□ -1.656e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 VPS72-203ENST00000463470 277 ntTSL 1 (best)4.73□□□□□ -1.653e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.666e-7■■■■■ 47.1
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 205.7 ms