Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms