Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF4BQ92750 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms