Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms