Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF4Q8WXU2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms