Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BRK1Q8WUW1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BRK1Q8WUW1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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