Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH3Q8TE77 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
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