Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms