Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms