Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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