Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms