Protein–RNA interactions for Protein: Q8N616

LINC00311, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00311, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00311Q8N616 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms