Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2M8

CLASRP, CLK4-associating serine/arginine rich protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASRPQ8N2M8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLASRPQ8N2M8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLASRPQ8N2M8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLASRPQ8N2M8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLASRPQ8N2M8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLASRPQ8N2M8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLASRPQ8N2M8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLASRPQ8N2M8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLASRPQ8N2M8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLASRPQ8N2M8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLASRPQ8N2M8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLASRPQ8N2M8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLASRPQ8N2M8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLASRPQ8N2M8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLASRPQ8N2M8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLASRPQ8N2M8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLASRPQ8N2M8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLASRPQ8N2M8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLASRPQ8N2M8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLASRPQ8N2M8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms