Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms