Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXP5

C11orf53, Uncharacterized protein C11orf53, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf53Q8IXP5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C11orf53Q8IXP5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms