Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms