Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms