Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HAPLN4Q86UW8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HAPLN4Q86UW8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HAPLN4Q86UW8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HAPLN4Q86UW8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HAPLN4Q86UW8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HAPLN4Q86UW8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HAPLN4Q86UW8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HAPLN4Q86UW8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HAPLN4Q86UW8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HAPLN4Q86UW8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HAPLN4Q86UW8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HAPLN4Q86UW8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms