Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms