Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms