Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms