Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms