Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms