Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
B4GALNT3Q6L9W6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4GALNT3Q6L9W6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms