Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GGNBP1Q5YKI7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms