Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SAMD13Q5VXD3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SAMD13Q5VXD3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SAMD13Q5VXD3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SAMD13Q5VXD3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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