Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BROXQ5VW32 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms