Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms