Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CEP170Q5SW79 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms