Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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