Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q56UQ5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q56UQ5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q56UQ5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms