Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms