Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms