Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q499Y3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q499Y3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q499Y3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q499Y3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q499Y3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q499Y3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q499Y3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q499Y3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q499Y3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q499Y3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q499Y3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q499Y3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q499Y3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q499Y3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q499Y3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q499Y3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q499Y3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q499Y3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q499Y3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q499Y3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q499Y3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q499Y3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q499Y3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q499Y3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q499Y3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q499Y3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q499Y3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q499Y3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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