Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms