Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms