Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms