Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms