Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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