Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms