Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CTF1Q16619 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CTF1Q16619 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CTF1Q16619 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CTF1Q16619 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CTF1Q16619 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CTF1Q16619 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CTF1Q16619 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CTF1Q16619 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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