Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CARTPTQ16568 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms