Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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DDB1Q16531 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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DDB1Q16531 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
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