Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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