Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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