Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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