Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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