Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms