Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms