Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC10A1Q14973 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms